Факултетот за применети науки ги проширува, збогатува и ја подобрува академската и практичната работа, прилагодувајќи се на трендовите и современите стандарди, првенствено на пазарот на трудот. Студиските програми на факултетот за применети науки се предвидени врз основа на искуствата на европските универзитети, како што се Штутгарт, Карлсруе, Виенскиот технички универзитет, итн. Студии на Факултетот за применети науки се организирани според моделот 4 (дипломирање) + 1 (магистратура), исто така и интегрирани студии, 5 годишни студии во студиската програма Архитектура. Студиските програми за Архитектура, Градежништво, Мехатроника и Сообраќајно-транспортно инженерство подготвуваат стручен и квалитетен кадар, кој многу лесно се вклучува во практичната работа на градежните оперативци, во организациите за урбанизација и проектирање, во металуршката и технолошката индустрија, како и во единиците за аналитика и планирање на сообраќајот.
Студиската програма Архитектура постојано се проширува, промовира и збогатува со научни, образовни и стручни активности, прилагодувајќи се на светските трендови и стандарди, како и на потребите на стопанството и општествените заедници. Образовните планови и програми за студии по архитектура постојано се усовршуваат во согласност со напредокот на науката и технологијата, а за возврат, во согласност со промените што се појавија во нашето општество, како и со потребите за проектирање, урбанизам и просторно планирање. Интеграцијата на студиските програми од прв и втор циклус обезбедува интеграција на професионалните способности и вештини на студентите кои ги завршиле студиите и можност за подобар пристап кон својата професија во согласност со националната рамка на професионални квалификации, како и постојано образование. и пристап до современи стручни и научни сознанија на кадар и стручни лица од областа на архитектурата, урбаното и просторното планирање кои работат на архитектонски проекти и градежни претпријатија, единиците на локалната самоуправа и други институции државни, јавни претпријатија, како и архитекти од научни институции и универзитети. Со тоа се обезбедува пристап до професијата архитект на различни нивоа и во различни области што нуди сеопфатен одговор на потребите на пазарот на труд во Република Македонија.
Студиска програма Градежништво има за цел да ги едуцира дипломирани инженери. Дипломираниот од оваа програма ќе ги стекне сите знаења и компетенции за професионално работење во областа на градежништвото, вклучително и развој на креативни вештини на главните проблеми, развој на критичко размислување и вештини за тимска работа, неопходни за градежни работи; како и едукација на стручњаци кои поседуваат основни знаења од областа на градежништвото и умеат да изнесуваат критички аргументи, хипотези, концепти и податоци при донесување одлуки и креативно решавање на инженерски прашања, учествуваат во планирање, проектирање и реализација на градежништво од големи размери проекти, да може да ги применува знаењата и вештините стекнати во понатамошниот професионален и академски развој и да се вклучат во инженерски и градежни истражувања користејќи квантитативна и квалитативна методологија на истражување.
Студиската програма Мехатроника ја претставува дисциплината механички системи, сензорски системи, микрометарски актуаторски системи. Инженери за мехатроника се вработени: во образование (како научен соработник или професор), приватни фирми (менаџери, водачи на работа), машински компании, во автомобилската индустрија или во областа на технологијата и комуникацијата, машинско програмирање за технолошка обработка на работа, како и во обезбедувањето дијагноза за оштетувања и грешки. Дипломираниот инженер по мехатроника има способност да дизајнира мехатронски системи, потоа го применува ова во различни производни и непроизводствени сектори, развива и дизајнира работа на опремата за мехатрониски системи, комбинира (интегрира) различни професионални области, како и го оптимизира и одредува нивото на работи преку добиените резултати, ги исполнува техничките и економските барања, го реализира дизајнот и примената во автоматски системи, контрола на процесите и флексибилни индустриски системи преку интеграција на хардвер и софтвер, управува со техничките работни тимови и нивните активности и се занимава со одржување на производствени капацитети и системи.
Студиската програма Сообраќајно-транспортно инженерство е дисциплина на ефикасно образование на инженери, чија професионалност ќе одговори на потребите за развој на општеството овде и пошироко во регионот. Дипломираниот инженер во оваа студиска програма е квалификуван за проектирање и имплементација на современи системи од областа на планирањето на сообраќајот, безбедноста на патиштата, организацијата, менаџментот (лидерството) во транспортните организации, транспортната логистика и зачувувањето на животната средина. Некои од можностите за вработување: транспортни организации кои се занимаваат со градски, меѓуградски и меѓународен транспорт; компании и агенции за одржување на патиштата; транспортниот инспекторат во министерството или општината; како референт за сообраќајниот извештај во министерството или општината; услуги каде се вршат технички контроли; канцеларија за професионални услуги за корисници на сообраќајот; проектантска канцеларија за патишта, проектирање на хоризонтална и вертикална сигнализација, како и физибилити студии за сообраќај; биро за вештачење на сообраќајни несреќи; осигурителни компании за утврдување на штети и права при осигурување на возила; предавач со сите права за управување со автошкола; во образованието (како научни соработници) или професори во средните стручни училишта; царински услуги; раководни позиции во сообраќајната полиција и единицата за сообраќајно-сообраќајни незгоди и др.